Project information
Evolution of genome size - a new role for the centromere drive
(Centrogenomtah)
- Project Identification
- GA20-15989S
- Project Period
- 1/2020 - 6/2023
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Faculty of Science
Jelikož mechanika buněčného dělení vyžaduje zachování poměru mezi velikostí chromosomů a kinetochorů, měly by změny ve velikosti kinetochoru být reflektovány velikostními změnami chromosomů (a v konečném důsledku i genomů). Přestože je centromerický tah („drajv“) široce akceptován jako mechanismus evoluce kinetochorů u eukaryot s asymetrickou meiózou, dopad tohoto tahu na evoluci velikosti chromosomů a velikosti genomu nebyl nikdy studován. S využitím karyologie (u mitotických metafází) a průtokové cytometrie (v interfázních jádrech) v kombinaci s imunofluorecenčním barvením proto hodláme fylogeneticky analyzovat, jak tempo v evoluci velikosti chromosomů a genomů koreluje s tempem evoluce velikosti kinetochorů a intenzitou pozitivní selekce v evoluci CenH3 napříč eukaryoty: u „drajvujících“ živočichů a semenných rostlin oproti „nedrajvujícím“ houbám, mechorostům, plavuním a kapradinám i na jemné fylogenetické škále v modelových Brassicaceae a Poaceae s jejichž využitím budou validovány a optimalizovány klíčové analytické techniky.
Publications
Total number of publications: 13
2021
-
Centromere Size Scales With Genome Size Across Eukaryotes
Scientific Reports, year: 2021, volume: 11, edition: 1, DOI
-
Holocentric Chromosomes Probably Do Not Prevent Centromere Drive in Cyperaceae
Frontiers in Plant Science, year: 2021, volume: 12, edition: February, DOI
2020
-
Is the evolution of carnivory connected with genome size reduction?
American Journal of Botany, year: 2020, volume: 107, edition: 9, DOI