Proteiny se v přírodě nacházejí ve velmi složitých směsích. Pro jejich analýzu jsou využívány moderní separační metody, které umožní vyčlenit ze vzorku pouze ty proteiny, jež chceme studovat. Velmi rozšířenou separační technikou je izoelektrická fokusace. Klasický mód kapilární izoelektrické fokusace však není vhodný pro separaci větších objemů vzorku. Použití módu izoelektrické fokusace ve volném toku umožňuje vzorek kontinuálně separovat a získávat tak jednotlivé frakce koncentrovaných proteinů.

Hlavním cílem tohoto projektu bude nová laboratorní úloha, která bude vypracována na zařízení pro preparativní izoelektrickou fokusaci v rozbíhavém toku vyvinutém na Ústavu analytické chemie AV ČR. Pro snadnou detekci bude jako vzorek použita směs přirozeně barevných proteinů a proteinů uměle barvených s odlišnými izoelektrickými body. Ke vzorku bude přidána směs nosných pufrů zajištující tvorbu pH gradientu. Separační lože bude tvořeno netkanou syntetickou nasákavou textilií. Pro zachování konstantní teploty bude celý experiment prováděn v chladicím boxu. Průběh experimentu bude zaznamenáván kamerou a online přenášen na obrazovku počítače. Po čase potřebném pro stabilizaci fokusace budou sbírány jednotlivé frakce separovaných proteinů. Tato metoda umožní materiálově a instrumentálně nenáročnou a velmi levnou frakcionaci proteinů před jejich další analýzou.