Project information
Vytvoření výzkumného týmu a mezinárodního konzorcia pro počítačový model buňky sinice
(CyanoTeam)
- Project Identification
- CZ.1.07/2.3.00/20.0256 (kod CEP: EE2.3.20.0256)
- Project Period
- 4/2012 - 3/2015
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Education, Youth and Sports of the CR
- Operational Programme Education for Competitiveness
- 2.3 Human resources in research and development
- MU Faculty or unit
- Faculty of Informatics
- Cooperating Organization
-
Institute of Systems Biology and Ecology of the ASCR, v. v. i.
Cílem projektu je posílit konkurenceschopnost českých vědců a doktorandů v oblasti bioinformatiky, bioenergetiky a počítačové vědy.
Cíle bude dosaženo vytvořením mezioborového vědeckého týmu CZ CyanoTeam vedeného
zahraničními experty. Druhým nástrojem bude konzorcium Global CyanoNetwork sdružené k zajištění spolupráce se zahraničními partnery.
Významným cílem bude i povýšení mezinárodního postavení zúčastněných vědeckých
pracovníků a doktorandů. Toho bude dosaženo spoluprací s hostujícími experty v CZ CyanoTeamu tak i zapojením v mezinárodních výzkumných programech v Global
CyanoNetworku. K posílení lidských zdrojů budou pořádány každoroční letní školy a semináře.
FI MU jako partner projektu s finanční podporou se bude účastnit vědeckého výzkumu (vývoj nástrojů pro analýzu a integraci vytvářených modelů). FI MU bude odpovědná za realizaci aktivity přesunu nových znalostí do výuky v rámci oboru bioinformatika na FI.
Publications
Total number of publications: 15
2015
-
Compact Representation of Photosynthesis Dynamics by Rule-based Models
5th International Workshop on Static Analysis and Systems Biology (SASB 2014), year: 2015
-
CyanoNetwork workshop - Cyanobacterium in silico 2015
Year: 2015, type: Workshop
2014
-
Biochemical Space: A Framework for Systemic Annotation of Biological Models
Proceedings of the 5th International Workshop on Interactions between Computer Science and Biology (CS2Bio’14), year: 2014
-
Epsilon-Semantics computations on biological systems
Information and computation, year: 2014, volume: 236, edition: 1, DOI
-
Model Checking in Systems Biology
Year: 2014, type:
-
Robustness Analysis of Stochastic Biochemical Systems
Plos One, year: 2014, volume: 9, edition: 4, DOI
-
STL*: Extending signal temporal logic with signal-value freezing operator
Information and computation, year: 2014, volume: 236, edition: January, DOI
2013
-
A Comprehensive Web-based Platform For Domain-Specific Biological Models
Proceedings of the fourth International Workshop on Interactions between Computer Science and Biology (CS2Bio'13), year: 2013
-
Esther: Introducing an Online Platform for Parameter Identification of Boolean Networks
Computational Methods in Systems Biology 11th International Conference, CMSB 2013, Klosterneuburg, Austria, September 22-24, 2013, Proceedings, year: 2013
-
Exploring Parameter Space of Stochastic Biochemical Systems Using Quantitative Model Checking
25th International Conference, CAV 2013, Saint Petersburg, Russia, July 13-19, 2013. Proceedings, year: 2013