Informace o projektu
Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
- Kód projektu
- NR8967
- Období řešení
- 1/2006 - 12/2009
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Resortní program výzkumu a vývoje - MZ
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Lékařská fakulta
- prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.
- Mgr. Petra Pospíšilová, Ph.D.
- prof. MUDr. Jan Šmarda, DrSc.
- Klíčová slova
- Treponema pallidum, srovnávací genomika, PCR diagnostika, nukleotidové polymorfismy
- Spolupracující organizace
-
Fakultní nemocnice U sv. Anny Brno
- Odpovědná osoba doc. MUDr. Vladana Woznicová, Ph.D.
- Odpovědná osoba Mgr. Monika Dvořáková Heroldová, Ph.D.
- Odpovědná osoba prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc.
- Odpovědná osoba MUDr. Jana Račovská
Projekt předpokládá vyšetření desítek až set kmenů a izolátů pddruhu T. pallidum ssp. apllidum v hypervariabilních oblastech genomu. Rozdíly v těchto sekvencích budou použity pro identifikaci individuálních kmenů tohoto poddruhu.
Rozdíly v genomech kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum budou zjišťovány po PCR amplifikaci sekvenací PCR produktů. Bude navržen zjednodušený protokol na identifikaci nejčastějších kmenů na základě PCR aplifikace a RFLP.
Publikace
Počet publikací: 90
2007
-
Srovnání pyrosekvenování a komparativní genomové sekvenace u Treponema pallidum subsp. pertenue Samoa D.
24. Kongres Československé společnosti mikrobiologické. Abstrakty., rok: 2007
-
Testování kandidátních lokusů pro typizaci klinických izolátů Treponema pallidum.
XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků., rok: 2007
-
Určení kompletní genomové sekvence kmene Treponema pallidum subsp. pertenue CDC-2
Rok: 2007, druh: Konferenční abstrakty
-
Určení kompletní genomové sekvence kmene Treponema pallidum subspecies pertenue CDC-2
Rok: 2007, druh: Konferenční abstrakty
-
Určovanie genómovej sekvencie Treponema pallidum subspecies pallidum kmeňa Dallas 1
Rok: 2007, druh: Konferenční abstrakty
2006
-
Analýza sigma-54 závislých promotorů spirochety Treponema pallidum.
Rok: 2006, druh: Konferenční abstrakty
-
Comparison ot the syphilis and yaws spirochete genomes: comparative genome sequencing of T. pallidum ssp. pallidum Samoa D.
Rok: 2006, druh: Konferenční abstrakty
-
Detekce původce syfilis Treponema pallidum subsp. pallidum v klinických vzorcích.
Rok: 2006, druh: Konferenční abstrakty
-
Detekce Treponema pallidum subsp. pallidum v biologickém materiálu, výhledy pro epidemiologii syfilis
XXI. Pečenkovy epidemiologické dny., rok: 2006
-
Diagnosis of syphilis by polymerase chain reaction and molecular typing of Treponema pallidum.
Reviews in Medical Microbiology, rok: 2006, ročník: 17, vydání: 4