Project information
Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
- Project Identification
- NR8967
- Project Period
- 1/2006 - 12/2009
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Health of the CR
- Ministry of Agriculture R&D Programme
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Medicine
- prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.
- Mgr. Petra Pospíšilová, Ph.D.
- prof. MUDr. Jan Šmarda, DrSc.
- Cooperating Organization
-
St. Anne's University Hospital Brno
- Responsible person doc. MUDr. Vladana Woznicová, Ph.D.
- Responsible person Mgr. Monika Dvořáková Heroldová, Ph.D.
- Responsible person prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc.
- Responsible person MUDr. Jana Račovská
Projekt předpokládá vyšetření desítek až set kmenů a izolátů pddruhu T. pallidum ssp. apllidum v hypervariabilních oblastech genomu. Rozdíly v těchto sekvencích budou použity pro identifikaci individuálních kmenů tohoto poddruhu.
Rozdíly v genomech kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum budou zjišťovány po PCR amplifikaci sekvenací PCR produktů. Bude navržen zjednodušený protokol na identifikaci nejčastějších kmenů na základě PCR aplifikace a RFLP.
Publications
Total number of publications: 90
2012
-
Molekulární detekce syfilis, kmenová typizace a stanovení makrolidové rezistence u původce syfilis - Treponema pallidum ssp. pallidum v klinickém materiálu.
Year: 2012, type: Conference abstract
2010
-
Celogenomové restrikční mapování u vybraných zástupců rodu Treponema.
Year: 2010, type: Conference abstract
-
Celogenomové restrikční mapování u 8 zástupců rodu Treponema.
Year: 2010, type: Conference abstract
-
Clarithromycin treatment failure due to macrolide resistance in Treponema pallidum in a patient with primary syphilis.
Acta Dermato-Venereologica, year: 2010, volume: 90, edition: 2
-
Complete genome sequence of T. paraluiscuniculi, strain Cuniculi A: an evidence for adaptation of T. paraluiscuniculi to rabbits.
Year: 2010, type: Conference abstract
-
Genome analysis of Treponema pallidum subsp. pallidum and subsp. pertenue strains by whole genome fingerprinting: most of the genetic differences are localized in six genomic regions.
PloS ONE, year: 2010, volume: 5, edition: 12
-
Identifikace genetických rozdílů mezi původci yaws a syfilis.
Year: 2010, type: Conference abstract
-
Molecular characterization of clinical isolates of Treponema pallidum subsp. pallidum in the Czech Republic.
Year: 2010, type: Conference abstract
-
Molekulární detekce syfilis: PCR diagnostika, typizace a detekce makrolidové rezistence u Treponema pallidum.
Year: 2010, type: Conference abstract
-
Najvirulentnejší zástupca rodu Treponema - Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 a jeho celogenómová sekvencia.
Year: 2010, type: Conference abstract