Informace o projektu
Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
- Kód projektu
- NR8967
- Období řešení
- 1/2006 - 12/2009
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Resortní program výzkumu a vývoje - MZ
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Lékařská fakulta
- prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.
- Mgr. Petra Pospíšilová, Ph.D.
- prof. MUDr. Jan Šmarda, DrSc.
- Klíčová slova
- Treponema pallidum, srovnávací genomika, PCR diagnostika, nukleotidové polymorfismy
- Spolupracující organizace
-
Fakultní nemocnice U sv. Anny Brno
- Odpovědná osoba doc. MUDr. Vladana Woznicová, Ph.D.
- Odpovědná osoba Mgr. Monika Dvořáková Heroldová, Ph.D.
- Odpovědná osoba prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc.
- Odpovědná osoba MUDr. Jana Račovská
Projekt předpokládá vyšetření desítek až set kmenů a izolátů pddruhu T. pallidum ssp. apllidum v hypervariabilních oblastech genomu. Rozdíly v těchto sekvencích budou použity pro identifikaci individuálních kmenů tohoto poddruhu.
Rozdíly v genomech kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum budou zjišťovány po PCR amplifikaci sekvenací PCR produktů. Bude navržen zjednodušený protokol na identifikaci nejčastějších kmenů na základě PCR aplifikace a RFLP.
Publikace
Počet publikací: 90
2007
-
Comparative pathogenomics of spirochetes.
Bacterial Pathogenomics, rok: 2007, počet stran: 19 s.
-
Detection of Treponema pallidum DNA from the Serum of an Adequately Treated Patient with Latent Syphilis.
Acta Dermato-Venereologica, rok: 2007, ročník: 87, vydání: 4
-
Detection of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14 from Skin Lesions,Serum, and CSF in an Infant with Congenital Syphilis after Clindamycin treatment of the mother during pragnancy.
Journal of Clinical Microbiology, rok: 2007, ročník: 2007, vydání: 45
-
Detekce a kmenová typizace spirochety Treponema pallidum subsp. pallidum v biologických vzorcích
Rok: 2007, druh: Konferenční abstrakty
-
Diagnostika a kmenová typizace spirochety Treponema pallidum v klinickém materiálu.
Rok: 2007, druh: Konferenční abstrakty
-
Diagnostika časné syfilis metodou PCR - klinická charakteristika vyšetřovaných a význam vyšetření.
Rok: 2007, druh: Konferenční abstrakty
-
Genetické rozdíly mezi původci yaws a syfilis.
XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, rok: 2007
-
Genome Differences between Treponema pallidum subsp. pallidum Strain Nichols and T. paraluiscuniculi Strain Cuniculi A
INFECTION AND IMMUNITY, rok: 2007, ročník: 75, vydání: 12
-
Genome of Treponema pallidum subsp. pertenue Samoa D:Comparison of pyrosequencing and comparative genome sequencing.
Rok: 2007, druh: Další prezentace na konferencích
-
Genomová struktura spirochet rodu Treponema.
24. Kongres Československé společnosti mikrobiologické.Abstrakty., rok: 2007