Informace o projektu
Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
- Kód projektu
- NR8967
- Období řešení
- 1/2006 - 12/2009
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Resortní program výzkumu a vývoje - MZ
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Lékařská fakulta
- prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.
- Mgr. Petra Pospíšilová, Ph.D.
- prof. MUDr. Jan Šmarda, DrSc.
- Klíčová slova
- Treponema pallidum, srovnávací genomika, PCR diagnostika, nukleotidové polymorfismy
- Spolupracující organizace
-
Fakultní nemocnice U sv. Anny Brno
- Odpovědná osoba doc. MUDr. Vladana Woznicová, Ph.D.
- Odpovědná osoba Mgr. Monika Dvořáková Heroldová, Ph.D.
- Odpovědná osoba prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc.
- Odpovědná osoba MUDr. Jana Račovská
Projekt předpokládá vyšetření desítek až set kmenů a izolátů pddruhu T. pallidum ssp. apllidum v hypervariabilních oblastech genomu. Rozdíly v těchto sekvencích budou použity pro identifikaci individuálních kmenů tohoto poddruhu.
Rozdíly v genomech kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum budou zjišťovány po PCR amplifikaci sekvenací PCR produktů. Bude navržen zjednodušený protokol na identifikaci nejčastějších kmenů na základě PCR aplifikace a RFLP.
Publikace
Počet publikací: 90
2012
-
Molekulární detekce syfilis, kmenová typizace a stanovení makrolidové rezistence u původce syfilis - Treponema pallidum ssp. pallidum v klinickém materiálu.
Rok: 2012, druh: Konferenční abstrakty
2010
-
Celogenomové restrikční mapování u vybraných zástupců rodu Treponema.
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Celogenomové restrikční mapování u 8 zástupců rodu Treponema.
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Clarithromycin treatment failure due to macrolide resistance in Treponema pallidum in a patient with primary syphilis.
Acta Dermato-Venereologica, rok: 2010, ročník: 90, vydání: 2
-
Complete genome sequence of T. paraluiscuniculi, strain Cuniculi A: an evidence for adaptation of T. paraluiscuniculi to rabbits.
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Genome analysis of Treponema pallidum subsp. pallidum and subsp. pertenue strains by whole genome fingerprinting: most of the genetic differences are localized in six genomic regions.
PloS ONE, rok: 2010, ročník: 5, vydání: 12
-
Identifikace genetických rozdílů mezi původci yaws a syfilis.
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Molecular characterization of clinical isolates of Treponema pallidum subsp. pallidum in the Czech Republic.
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Molekulární detekce syfilis: PCR diagnostika, typizace a detekce makrolidové rezistence u Treponema pallidum.
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Najvirulentnejší zástupca rodu Treponema - Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 a jeho celogenómová sekvencia.
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty