Go to main content | Go to main menu | Go to search

Project information
Personalyzed treatment in pediatric oncology: on the way to liquid dynamic medicine and N-of-1 trials (PM-KDO 2024)

Project Identification
MUNI/A/1625/2023
Project Period
1/2024 - 12/2024
Investor / Pogramme / Project type
Masaryk University
  • Specific research - support for student projects
MU Faculty or unit
Faculty of Medicine

Projekt vychází z dlouhodobého odborného zaměření Kliniky dětské onkologie a nadále rozvíjí a navazuje na projekt MUNI/A/1395/2022 a další projekty podobného zaměření řešené v minulých letech. Je v souladu s nejmodernějšími trendy současné onkologie tj. personalizované léčby či „precision oncology“. Postupy personalizované léčby jsou založeny na podrobném vyšetření konkrétního onemocnění, jeho vývoji v čase (opakované biopsie – klonální vývoj), biologické analýzy i genetického pozadí pacienta. K tomuto účelu se využívají jak komerčně dostupné, tak „in-house“ akademické postupy založené na molekulárně biologických technologiích. Data jsou podrobena bioinformatické analýze, která tvoří neoddělitelnou součást těchto tzv. theranostických přístupů. Biologický materiál analyzujeme sekvenováním nové generace NGS (whole exome/genome sequencing), dále využíváme transkripční profilování (RNAseq), detekci fosforylace receptorových tyrosinkináz a detekci specifických translokací/genových fúzí. Panel vyšetření byl rozšířen o sekvenování metylomu, liquid biopsy a v roce 2020 o MLPA a celoexomové sekvenování s nízkým pokrytím a další. Získané informace jsou hodnoceny v rámci pravidelných odborných setkání – tzv. expertního panelu („molecular oncology tumor boardu“), na základě kterého je vydáno konkrétní léčebné doporučení s cílem zlepšit léčebné výsledky u pacientů s vysoce rizikovým nádorovým onemocněním, jako jsou děti s refrakterními a relabujícími solidními nádory a non-Hodgkinskými lymfomy (NHL), pro které není definován standardní léčebný postup. Toho je možné dosáhnout personalizovanými postupy v rámci theranostického principu, jak dokladují naše publikované výsledky. Každému pacientovi, který je diskutován v rámci expertního panelu, je možné navrhnout individualizovaný léčebný plán. Ten je založen buď na cílené léčbě, pokud je nalezen vhodný léčebný cíl nebo na empirické či metronomické léčbě nebo jejich kombinace a to na základě komplexního zhodnocení biologického profilu, klinického stavu, anamnézy a dalších individuálních faktorů.

Sustainable Development Goals

Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.

Sustainable Development Goal No. 3 – Good health and well-being Sustainable Development Goal No. 4 – Quality education

Publications

Total number of publications: 9

2024

  • A computational workflow for analysis of missense mutations in precision oncology

    KHAN Rayyan Tariq POKORNÁ Petra DVORSKÝ Jan BORKO Simeon AREFIEV Ihor PLANAS IGLESIAS Joan DOBIÁŠ Adam RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO José Gaspar SZOTKOWSKÁ Veronika ŠTĚRBA Jaroslav SLABÝ Ondřej DAMBORSKÝ Jiří MAZURENKO Stanislav BEDNÁŘ David

    Article in Periodical

    JOURNAL OF CHEMINFORMATICS, year: 2024, volume: 16, edition: 1, DOI

  • Analysis of mutations in precision oncology using the automated, accurate, and user-friendly web tool PredictONCO

    KHAN Rayyan Tariq POKORNÁ Petra DVORSKÝ Jan BORKO Simeon DOBIÁŠ Adam PLANAS IGLESIAS Joan MAZURENKO Stanislav AREFIEV Ihor RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO José Gaspar SZOTKOWSKÁ Veronika ŠTĚRBA Jaroslav DAMBORSKÝ Jiří SLABÝ Ondřej BEDNÁŘ David

    Article in Periodical

    Computational and Structural Biotechnology Journal, year: 2024, volume: 24, edition: December 2024, DOI

  • Clinical and biological landscape of constitutional mismatch-repair deficiency syndrome: an International Replication Repair Deficiency Consortium cohort study

    ERCAN Ayse Bahar ARONSON Melyssa FERNANDEZ Nicholas R CHANG Yuan LEVINE Adrian LIU Zhihui Amy NEGM Logine EDWARDS Melissa BIANCHI Vanessa STENGS Lucie CHUNG Jiil AL-BATTASHI Abeer RESCHKE Agnes LION Alex AHMAD Alia LASSALETTA Alvaro REDDY Alyssa T AL-DARRAJI Amir F SHAH Amish C AN Van Damme BENDEL Anne RASHID Aqeela MARGOL Ashley S KELLY Bethany L PENCHEVA Bojana HEALD Brandie LEMIEUX-ANGLIN Brianna CROOKS Bruce KOSCHMANN Carl GILPIN Catherine PORTER Christopher C GASS David SAMUEL David ZIEGLER David S BLUMENTHAL Deborah T KUO Dennis John HAMIDEH Dima BASEL Donald KHUONG-QUANG Dong-Anh STEARNS Duncan OPOCHER Enrico CARCELLER Fernando FELDMAN Hagit Baris TOLEDANO Helen WINER Ira SCHEERS Isabelle FEDORAKOVA Ivana SU Jack M VENGOECHEA Jaime ŠTĚRBA Jaroslav KNIPSTEIN Jeffrey HANSFORD Jordan R GONZALES-SANTOS Julieta Rita BHATIA Kanika BIELAMOWICZ Kevin J MINHAS Khurram NICHOLS Kim E COLE Kristina A PENNEY Lynette HJORT Magnus Aasved SABEL Magnus GIL-DA-COSTA Maria Joao MURRAY Matthew J MILLER Matthew BLUNDELL Maude L MASSIMINO Maura AL-HUSSAINI Maysa AL-JADIRY Mazin F COMITO Melanie A OSBORN Michael LINK Michael P ZAPOTOCKY Michal GHALIBAFIAN Mithra SHAHEEN Najma MUSHTAQ Naureen WAESPE Nicolas HIJIYA Nobuko FUENTES-BOLANOS Noemi AHMAD Olfat CHAMDINE Omar ROY Paromita PICHURIN Pavel N NYMAN Per PEARLMAN Rachel AUER Rebecca C SUKUMARAN Reghu K KEBUDI Rejin DVIR Rina RAPHAEL Robert ELHASID Ronit MCGEE Rose B CHAMI Rose NOSS Ryan TANAKA Ryuma RASKIN Salmo SEN Santanu LINDHORST Scott PERREAULT Sebastien CASPI Shani RIAZ Shazia CONSTANTINI Shlomi ALBERT Sophie CHALEFF Stanley BIELACK Stefan CHIARAVALLI Stefano CRAMER Stuart Louis ROY Sumita CAHN Suzanne PENNA Suzanne HAMID Syed Ahmer GHAFOOR Tariq IMAM Uzma LAROUCHE Valerie ISSAI Vanan Magimairajan FOULKES William D LEE Yi Yen NATHAN Paul C MARUVKA Yosef E GREER Mary-Louise C DURNO Carol SHLIEN Adam ERTL-WAGNER Birgit VILLANI Anita MALKIN David HAWKINS Cynthia BOUFFET Eric DAS Anirban TABORI Uri

    Article in Periodical

    Lancet Oncology, year: 2024, volume: 25, edition: 5, DOI

  • Dataset of DNA methylation profiles of 189 pediatric central nervous system, soft tissue, and bone tumors

    JUGAS Robin POKORNÁ Petra ADAMCOVÁ Soňa KOŽELKOVÁ Kateřina KNOFLÍČKOVÁ Dana PÁLOVÁ Hana ŠTĚRBA Jaroslav SLABÝ Ondřej

    Article in Periodical

    Data in Brief, year: 2024, volume: 55, edition: August 2024, DOI

  • Diagnostic efficacy and clinical utility of whole-exome sequencing in Czech pediatric patients with rare and undiagnosed diseases

    SLABÁ Kateřina POKORNÁ Petra JUGAS Robin PÁLOVÁ Hana PROCHÁZKOVÁ Dagmar AULICKÁ Štefánia ŠPANĚLOVÁ Klára DANHOFER Pavlína HORÁK Ondřej TUČKOVÁ Jana KLEIBLOVÁ Petra GAILLYOVÁ Renata HRUNKA Matěj JOUZA Martin PINKOVÁ Blanka PAPEŽ Jan KONEČNÁ Petra ZÍDKOVÁ Jana ŠTOURAČ Petr ŠTĚRBA Jaroslav DEMLOVÁ Regina DEMLOVÁ Eva JABANDŽIEV Petr SLABÝ Ondřej

    Article in Periodical

    SCIENTIFIC REPORTS, year: 2024, volume: 14, edition: 1, DOI

  • Dysregulation of the p53 pathway provides a therapeutic target in aggressive pediatric sarcomas with stem-like traits

    CURYLOVÁ Lucie ZAMBO Iva NERADIL Jakub KÝR Michal JURAČKOVÁ Nicola PAVLOVÁ Šárka POLÁŠKOVÁ Kristýna MÚDRY Peter ŠTĚRBA Jaroslav VESELSKÁ Renata ŠKODA Jan

    Article in Periodical

    CELLULAR ONCOLOGY, year: 2024, volume: 47, edition: 6, DOI

  • Personalized dendritic cell vaccine in multimodal individualized combination therapy improves survival in high-risk pediatric cancer patients

    KÝR Michal MÚDRY Peter POLÁŠKOVÁ Kristýna ZDRAŽILOVÁ DUBSKÁ Lenka DEMLOVÁ Regina KUBÁTOVÁ Jana HLAVÁČKOVÁ Eva ČERNÁ PILÁTOVÁ Kateřina MAZANEK Pavel VEJMĚLKOVÁ Klára DUŠEK Vítězslav TINKA Pavel BALÁŽ Martin MERTA Tomáš KUTTNEROVÁ Zuzana TUREKOVÁ Terézia PAVELKA Zdeněk POKORNÁ Petra PÁLOVÁ Hana MLNAŘÍKOVÁ Marie JEŽOVÁ Marta KELLNEROVÁ Renata KOZAKOVA Sarka SLABÝ Ondřej VALÍK Dalibor ŠTĚRBA Jaroslav

    Article in Periodical

    International journal of cancer, year: 2024, volume: 155, edition: 8, DOI

  • Precision immuno-oncology approach for four malignant tumors in siblings with constitutional mismatch repair deficiency syndrome

    PÁLOVÁ Hana DAS Anirban POKORNÁ Petra BAJČIOVÁ Viera PAVELKA Zdenek JEŽOVÁ Marta PÁL Karol DIMAYACYAC Jose R NEGM Logine STENGS Lucie BIANCHI Vanessa VEJMĚLKOVÁ Klára NOSKOVÁ Kristýna JAROŠOVÁ Marie MEJSTŘÍKOVÁ Soňa MÚDRY Peter KÝR Michal MERTA Tomáš TINKA Pavel DRÁBOVÁ Klára AULICKÁ Štefánia JUGAS Robin TABORI Uri SLABÝ Ondřej ŠTĚRBA Jaroslav

    Article in Periodical

    NPJ PRECISION ONCOLOGY, year: 2024, volume: 8, edition: 1, DOI

  • Real-World Performance of Integrative Clinical Genomics in Pediatric Precision Oncology

    POKORNÁ Petra PÁLOVÁ Hana ADAMCOVÁ Soňa JUGAS Robin AL TUKMACHI Dagmar KÝR Michal KNOFLÍČKOVÁ Dana KOŽELKOVÁ Kateřina BYSTRÝ Vojtěch MEJSTŘÍKOVÁ Soňa MERTA Tomáš TRACHTOVÁ Karolína HLOUŠKOVÁ Eliška MÚDRY Peter PAVELKA Zdeněk BAJČIOVÁ Viera TINKA Pavel JAROŠOVÁ Marie CATELA IVKOVIĆ Tina MADLENER Sibylle PÁL Karol STEPIEN Natalia MAYR Lisa TICHÝ Boris NOVÁKOVÁ Klára JEŽOVÁ Marta KOZÁKOVÁ Šárka VAŇÁČKOVÁ Jitka RADOVÁ Lenka STEININGER Karin HABERLER Christine GOJO Johannes ŠTĚRBA Jaroslav SLABÝ Ondřej

    Article in Periodical

    Laboratory Investigation, year: 2024, volume: 104, edition: 12, DOI

You are running an old browser version. We recommend updating your browser to its latest version.

More info