Project information
Proteotypová klasifikace renálního karcinomu ve vztahu k prognóze a terapeutické odpovědi
- Project Identification
- NV19-08-00250
- Project Period
- 5/2019 - 12/2023
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Health of the CR
- Ministry of Health Research Programme 2015 - 2022
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Science
- doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.
- Mgr. Pavla Bouchalová, Ph.D.
- Mgr. Lucia Janáčová, Ph.D.
- Mgr. Petr Lapčík, Ph.D.
- Cooperating Organization
-
University Hospital Pilsen
- Responsible person prof. MUDr. Milan Hora, Ph.D., MBA
- Responsible person MUDr. Ondřej Fiala, Ph.D.
- Responsible person doc. MUDr. Alexandr Poprach, Ph.D.
- Responsible person MUDr. Alice Hlobilková, Ph.D.
- Responsible person doc. MUDr. Radek Lakomý, Ph.D.
- Responsible person MUDr. Ján Podhorec
Renální karcinom (RCC) přestavuje závažné onkologické onemocnění s celosvětově nejvyšší incidencí v České republice, přičemž spolehlivé molekulární prognostické a prediktivní biomarkery nejsou dosud k dispozici. Pro jejich “high-throughput“ vyhledávání a validaci zavedeme novou metodiku digitálního biobankingu založenou na získávání proteinových fingerprintů (proteotypů) pomocí hmotnostní spektrometrie v tzv. “data independent acquisition” módu. S využitím nově zavedené techniky budou analyzovány dva velmi dobře charakterizované soubory nádorů, získaná data budou statisticky hodnocena s cílem nalézt: (i) proteinové biomarkery identifikující pacienty s lokalizovaným RCC avšak s vyšším rizikem, kteří by měli být detailněji sledováni, a (ii) proteinové biomarkery související se špatnou odpovědí metastatických nádorů ledvin na léčbu tyrosinkinasovými inhibitory v první linii. Očekáváme, že nalezené patterny, potenciální biomarkery, resp. potenciální terapeutické cíle pomohou přispět k zefektivnění terapie pacientů s nádory ledvin.
Publications
Total number of publications: 28
2022
-
Proteiny odpovědné za špatnou terapeutickou odpověď metastatických nádorů ledvin na léčbu tyrosinkinasovými inhibitory
Year: 2022, type: Conference abstract
-
Proteotype classification of renal cell carcinoma for prognosis and therapy response
Year: 2022, type: Conference abstract
2021
-
A large-scale assay library for targeted protein quantification in renal cell carcinoma tissues
Year: 2021, type: Conference abstract
-
DIA-MS Identifies and Validates Transgelin as Protein Contributing to a Poor Response of Metastatic Renal Cell Carcinoma to Sunitinib Treatment
Year: 2021, type: Conference abstract
-
Proteotypová analýza renálního karcinomu ve vztahu k prognóze a terapeutické odpovědi
Year: 2021, type: Appeared in Conference without Proceedings
-
SWATH-MS identifikácia stathminu ako potenciálneho markeru nádorov endometria u pacientok liečených tamoxifenom analýzou FFPE tkanív
Year: 2021, type: Conference abstract
-
Transgelin Contributes to a Poor Response of Metastatic Renal Cell Carcinoma to Sunitinib Treatment
Biomedicines, year: 2021, volume: 9, edition: 9, DOI
2020
-
Cytoreductive Nephrectomy and Overall Survival of Patients with Metastatic Renal Cell Carcinoma Treated with Targeted Therapy-Data from the National Renis Registry
Cancers, year: 2020, volume: 12, edition: 10, DOI
-
Desmocollin-1 plays a role in breast cancer cell migration, invasion and metastasis and is modulated by parthenolide
Year: 2020, type: Conference abstract
-
How Different Are the Molecular Mechanisms of Nodal and Distant Metastasis in Luminal A Breast Cancer?
Cancers, year: 2020, volume: 12, edition: 9, DOI