Informace o projektu
Mapování výskytu makrolidové rezistence původce syfilis v ČR a molekulární typizace jednotlivých syfilitických kmenů

Kód projektu

NT11159

Období řešení

9/2010 - 12/2014

Investor / Programový rámec / typ projektu

Ministerstvo zdravotnictví ČR

Resortní program výzkumu a vývoje - MZ III. na léta 2010 - 2015 (IGA)

Fakulta / Pracoviště MU

Lékařská fakulta

Spolupracující organizace

Státní zdravotní ústav Praha 10 - Vinohrady

Odpovědná osoba Ing. Jana Kalinová, Ph.D.

Celogenomová sekvenace několika kmenů Treponema pallidum (TP, t.j. kmenů
Nichols, SS14, Mexico A a DAL-1) umožnila vývoj vysoce specifické PCR
diagnostiky TP. PCR detekce treponemální DNA umožňuje identifikovat
kmenově specifické genomové sekvence a také geneticky vyšetřovat citlivost
na některá antibiotika. Cílem projektu je sběr klinických vzorků z ČR a to
zejména anogenitálních stěrů a vzorků plné krve. Z těchto vzorků budeme
izolovat treponemální DNA, kterou budeme po amplifikaci sekvenovat (ve
variabilních chromosomálních lokusech). Navíc budeme molekulárně
biologicky určovat rezistenci k makrolidovým antibiotikům a klindamycinu.
Sekvence získané z různých izolátů TP budou srovnány a profil
jednonukleotidových záměn, delecí a inzercí bude využit pro shlukovací
analýzu treponemálních izolátů a pro epidemiologické účely. Dále budeme
vyvíjet rychlejší a levnější diagnostické testy pro molekulární typizaci
původce syfilis.

Publikace

Počet publikací: 24

2016

Treponema pallidum, the syphilis spirochete: making a living as a stealth pathogen

RADOLF Justin D. DEKA Ranjit K. ANAND Arvind ŠMAJS David NORGARD Michael V. YANG X. Frank

Článek v odborném periodiku

Nature Reviews Microbiology, rok: 2016, ročník: 14, vydání: 12, DOI

2015

A Retrospective Study on Genetic Heterogeneity within Treponema Strains: Subpopulations Are Genetically Distinct in a Limited Number of Positions

ČEJKOVÁ Darina STROUHAL Michal NORRIS Steven J. WEINSTOCK George M. ŠMAJS David

Článek v odborném periodiku

PLoS Neglected Tropical Diseases, rok: 2015, ročník: 9, vydání: 10, DOI
Rezistence původce syfilis, Treponema pallidum subsp. pallidum, k makrolidovým antibiotikům v České republice a ve světě

GRILLOVÁ Linda MIKALOVÁ Lenka ZAKOUCKÁ H. ŽIDLICKÁ J. ŠMAJS David

Článek v odborném periodiku

Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie, rok: 2015, ročník: 64, vydání: 1
The 2 simultaneously Published "k" Sequence Variants of tp0548 Locus of Treponema pallidum ssp. pallidum Isolates Differ: The One Published Later Has to Be Renamed as "l"

GRILLOVÁ Linda STROUHAL Michal MIKALOVÁ Lenka ŠMAJS David

Článek v odborném periodiku

Sexually Transmitted Diseases, rok: 2015, ročník: 42, vydání: 1, DOI
Uncultivable Pathogenic Treponemes

ŠMAJS David STROUHAL Michal

Kapitola v knize

Molecular Medical Microbiology. Vol. 3, vydání: Vyd. 2nd ed., rok: 2015, počet stran: 16 s.

2014

Molecular Typing of Treponema pallidum in the Czech Republic during 2011 to 2013: Increased Prevalence of Identified Genotypes and of Isolates with Macrolide Resistance

GRILLOVÁ Linda PĚTROŠOVÁ Helena MIKALOVÁ Lenka STRNADEL Radim DASTYCHOVÁ Eliška KUKLOVÁ Ivana KOJANOVÁ Martina KREIDLOVÁ Miluše VAŇOUSOVÁ Daniela HERCOGOVÁ Jana PROCHÁZKA Přemysl ZÁKOUCKÁ Hana KRCHŇÁKOVÁ Alena VAŠKŮ Vladimír ŠMAJS David

Článek v odborném periodiku

Journal of Clinical Microbiology, rok: 2014, ročník: 52, vydání: 10, DOI
Syphilis-causing strains belong to separate SS14-like or Nichols-like groups as defined by multilocus analysis of 19 Treponema pallidum strains

NECHVÁTAL Lukáš PĚTROŠOVÁ Helena GRILLOVÁ Linda POSPÍŠILOVÁ Petra MIKALOVÁ Lenka STRNADEL Radim KUKLOVÁ Ivana KOJANOVÁ Martina KREIDLOVÁ Miluše VAŇOUSOVÁ Daniela PROCHÁZKA Přemysl ZÁKOUCKÁ Hana KRCHŇÁKOVÁ Alena ŠMAJS David

Článek v odborném periodiku

International Journal of Medical Microbiology, rok: 2014, ročník: 304, vydání: 5-6, DOI
The Molecular Typing Data of Recently Identified Subtype 11q/j of Treponema pallidum subsp. pallidum Suggest Imported Case of Yaws.

MIKALOVÁ Lenka STROUHAL Michal GRILLOVÁ Linda ŠMAJS David

Článek v odborném periodiku

Sexually transmitted diseases, rok: 2014, ročník: 41, vydání: 9
Whole Genome Sequence of the Treponema pallidum subsp. endemicum Strain Bosnia A: The Genome Is Related to Yaws Treponemes but Contains Few Loci Similar to Syphilis Treponemes

ŠTAUDOVÁ Barbora STROUHAL Michal ZOBANÍKOVÁ Marie ČEJKOVÁ Darina FULTON Lucinda L. CHEN Lei GIACANI lorenzo CENTURION-LARA Arturo BRUISTEN Sylvia M. SODERGREN Erica WEINSTOCK George M. ŠMAJS David

Článek v odborném periodiku

PLoS neglected tropical diseases, rok: 2014, ročník: 8, vydání: 11, DOI

2013

Cell cycle genes co-expression in multiple myeloma and plasma cell leukemia

KRYUKOV Fedor DEMENTYEVA Elena Vladimirovna KUBICZKOVÁ Lenka JARKOVSKÝ Jiří BROŽOVÁ Lucie PETRÍK Jakub NĚMEC Pavel ŠEVČÍKOVÁ Sabina MINARIK Jiri STEFANIKOVA Zdena KUGLÍK Petr HÁJEK Roman

Článek v odborném periodiku

Genomics, rok: 2013, ročník: 102, vydání: 4, DOI