New path planning method for computation of constrained dynamic channels in proteins
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2011 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | WSCG Full papers proceedings |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| www | http://wscg.zcu.cz/WSCG2011/!_2011_WSCG_Full_papers.pdf |
| Obor | Informatika |
| Klíčová slova | protein; path planning; collision-free path; constrained dynamic channel |
| Popis | Bezkolizní cesty v geometrickém modelu molekuly proteinu odkrývají různé závislosti mezi strukturou a funkcí molekuly. Cesty spojující biochemicky důležité části uvnitř proteinu s povrchem mohou sloužit jako vstupní nebo výstupní cesty pro malé molekuly (substráty), které mohou v těchto důležitých částech zreagovat a tím i změnit funkci celého proteinu. Geometrický plánovací algoritmus prezentován v tomto článku byl navržen pro hledání cest v prostředí hustě pokrytém sférickými pohybujícími se překážkami. Ukázková implementace řeší výpočet bezkolizních cest v molekulárním prostředí. Na algoritmus jsou kladeny další omezující podmínky např. časová souslednost průchodu robota. Algoritmus byl testován na reálných datech a z výsledků můžeme konstatovat, že pokud byla cesta v datech přítomna, náš algoritmus ji úspěšně detekoval. |
| Související projekty: |