Protein composition of Paracoccus denitrificans cells grown on various electron acceptors and in the presence of azide
| Název česky | Proteinové složení buněk bakterie Paracoccus denitrificans rostlých na různých terminálních akceptorech a v přítomnosti azidu |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2004 |
| Druh | Článek v odborném periodiku |
| Časopis / Zdroj | Proteomics |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| www | |
| Obor | Biochemie |
| Klíčová slova | Paracoccus denitrificans; Protein database; Proteome; Terminal electron acceptor; Two-dimensional electrophoresis |
| Popis | Celobuněčné lyzáty a membránové frakce bakterie Paracoccus denitrificans byly analyzovány pomocí dvourozměrné elektroforézy s imobilizovanými pH gradienty s cílem charakterizovat rozdíly v expresi proteinů během růstu za aerobních a několika typech anaerobních podmínek (s dusičnanem, dusitanem a oxidem dusným). Komparativní obrazová analýza 2-D gelů odhalila několik skupin z celkového počtu 800 proteinových skvrn, které byly charakteristicky indukovány anebo potlačeny v odpovědi na daný terminální akceptor elektronů. Také respirační inhibitor azid vykazoval významné ovlivnění proteinových profilů. Jelikož však většina proteinů ovlivněných azidem v buňkách rostlých aerobně není totožná s proteiny v buňkách rostlých anaerobně na dusitanu, domníváme se, že azid účinkuje převážně nepřímo prostřednictvím dalších buněčných signálů. Omezená informace o genomu studované bakterie neumožnila identifikovat více než 8 fyziologicky významných proteinů. Veřejně dostupná 2-DE databáze P.denitrificans je dostupná na adrese http://www.mpiib-berlin.mpg.de/2D-PAGE. |
| Související projekty: |