MAPHIS - Measuring arthropod phenotypes using hierarchical image segmentations

Varování

Publikace nespadá pod Lékařskou fakultu, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	MRÁZ Radoslav ŠTĚPKA Karel PEKÁR Matěj MATULA Petr PEKÁR Stanislav
Rok publikování	2023
Druh	Software
Fakulta / Pracoviště MU	Fakulta informatiky
www	Software repository https://maphis.fi.muni.cz/
Popis	MAPHIS is an open-source application allowing users to create hierarchichal segmentations of arthropods, extract various measurements from the generated segmentations and finally export the measurements for further analysis. The application features an automatic segmentation method (with the use of a convolutional neural network) and several interactive tools. Furthermore, through its plugin system users can extend or customize the capabilities of the application.
Související projekty:	Mimetic complexes and the evolution of inaccurate mimics Czech BioImaging: Národní výzkumná infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování