E-Cyanobacterium.org: A Web-Based Platform for Systems Biology of Cyanobacteria

• Autoři: TROJÁK Matej; ŠAFRÁNEK David; HRABEC Jakub; ŠALAGOVIČ Jakub; ROMANOVSKÁ Františka; ČERVENÝ Jan
• Rok publikování: 2016
• Druh: Článek ve sborníku
• Konference: Computational Methods in Systems Biology. CMSB 2016.
• Fakulta / Pracoviště MU: Fakulta informatiky
• www: http://link.springer.com/chapter/10.1007%2F978-3-319-45177-0_20
• Doi: http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-45177-0_20
• Obor: Informatika
• Klíčová slova: systems biology; model repository; model analysis; model specification
• Popis: E-cyanobacterium.org is an online platform providing tools for public sharing, annotation, analysis, and visualization of dynamical models and wet-lab experiments related to cyanobacteria. The platform is unique in integrating abstract mathematical models with a precise consortium-agreed biochemical description provided in a rule-based formalism. The general aim is to stimulate collaboration between experimental and computational systems biologists to achieve better understanding of cyanobacteria.

Související projekty

• Získávání parametrů biologických modelů pomocí techniky ověřování modelů
• The national infrastructure C4SYS - Centre for Systems Biology