Informace o projektu
Biochemie na rozcestí mezi in silico a in vitro
- Kód projektu
- GD203/09/H046
- Období řešení
- 1/2009 - 12/2012
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Doktorské granty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
- Spolupracující organizace
-
Univerzita Palackého v Olomouci
- Odpovědná osoba prof. RNDr. Michal Otyepka, Ph.D.
Publikace
Počet publikací: 29
2012
-
Understanding the Sequence Preference of Recurrent RNA Building Blocks using Quantum Chemistry: The Intrastrand RNA Dinucleotide Platform
Journal of Chemical Theory and Computation, rok: 2012, ročník: 8, vydání: 1, DOI
-
Unwinding of synthetic replication and recombination substrates by Srs2
DNA Repair, rok: 2012, ročník: 11, vydání: 10, DOI
2011
-
Noncanonical Hydrogen Bonding in Nucleic Acids. Benchmark Evaluation of Key Base-Phosphate Interactions in Folded RNA Molecules Using Quantum-Chemical Calculations and Molecular Dynamics Simulations
JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY A, rok: 2011, ročník: 115, vydání: 41, DOI
-
QM/MM Studies of Hairpin Ribozyme Self-Cleavage Suggest the Feasibility of Multiple Competing Reaction Mechanisms
JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B, rok: 2011, ročník: 115, vydání: 47, DOI
-
Reconstitution of DNA repair synthesis in vitro and the role of polymerase and helicase activities
DNA Repair, rok: 2011, ročník: 10, vydání: 6, DOI
2010
-
Cdk1 targets Srs2 to complete synthesis-dependent strand annealing and to promote
PLoS Genetics, rok: 2010, ročník: 2010, vydání: 2
-
Rad52 SUMOylation affects the efficiency of the DNA repair
Nucleic Acids Research, rok: 2010, ročník: 38, vydání: 6
-
Srs2: the Odd-Job Man in DNA repair
DNA Repair, rok: 2010, ročník: 9, vydání: 3
2009
-
Co-operativity of Mus81-Mms4 with Rad54 in the resolution of recombination and replication intermediates.
J Biol Chem., rok: 2009, ročník: 284, vydání: 12
-
DNA OPRAVA A NESTABILITA GENOMU
Rok: 2009, druh: Prezentace v oblasti VaV (AV tvorba, WEB aplikace apod.)