Informace o projektu
Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
- Kód projektu
- MSM 143300002
- Období řešení
- 1/1999 - 12/2004
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Výzkumné záměry
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- image analysis; image processing; segmentation; preprocessing; deconvolution; 3D analysis; 3D reconstruction; mathematical morphology; parallel computing; parallel algorithms; optical microscopy; confocal microscopy; automation; automated microscopy
Cíl: Cílem projektu je výzkum v oblasti počítačové analýzy mikroskopického obrazu, v oblasti automatizace procesu snímání a on-line analýzy obrazu a aplikace získaných poznatků v praxi. Návrh předpokládá jak pokračování v běžícím výzkumu struktury buněčného jádra s klinickým uplatněním při diagnostice a prevenci leukémií a jiných nádorových onemocnění, tak rozšíření výzkumu na jiné aplikace počítačové analýzy mikroskopického obrazu, biomedicínské i průmyslové. Obsah: Zkoumány budou zejména algoritmy předzpracování a segmentace obrazu s důrazem na dekonvoluci 3D obrazu, na operace matematické morfologie a na 3D rekonstrukci obrazu ze série 2D obrazových řezů. Intenzivní výzkum bude veden také v oblasti paralelních algoritmů analýzy obrazu a paralelizace vybraných algoritmů na víceprocesorových pracovních stanicích s využitím vybavení Superpočítačového centra MU.Vzhledem ke značné interdisciplinárnosti,bude udržována těsná spolupráce s kolegy ze špičkových pracovišť v Oxfordu,Heidelbergu a dalších míst.
Výsledky
Cílem projektu je výzkum v oblasti počítačové analýzy mikroskopického obrazu, v oblasti automatizace procesu snímání a on-line analýzy obrazu a aplikace získaných poznatků v praxi.
Publikace
Počet publikací: 88
2002
-
Algorithms and data representation in the FISH 3.0 image processing system
Biophysics of the genome and its interactions, rok: 2002
-
Automated micro axial tomography of cell nuclei after specific labelling by fluorescence in situ hybridisation
Micron, rok: 2002, ročník: 33, vydání: 7
-
Automated multi-view 3D image acquisition in human genome research
3D data processing, visualization and transmission, rok: 2002
-
Biophysics of the Genome and Its Interactions
Rok: 2002, druh: Editorství tématického sborníku
-
Cell Nuclei Segmentation Using Star-Shaped Simplex Meshes
Biophysics of the Genome and Its Interactions, rok: 2002
-
Cytogenetics of Retinoblastoma
Biophysics of the genome and its interactions, rok: 2002
-
Development of software for automated micro-axialtomography
Biophysics of the genome and its interactions, rok: 2002
-
Effectivity of Spherical Object Reconstruction Using Star-Shaped Simplex Meshes
1st International Symposium on 3D Data Processing Visualization and Transmission, rok: 2002
-
FISH 3.0 client-server system for 3D optical microscope data storage and analysis
Biophysics of the genome and its interactions, rok: 2002
-
High-resolution cytometry network project: Towards remote and distributed acquisition, processing and visualisation of 3D image data in human genome research
3D data processing, visualization and transmission, rok: 2002