Informace o projektu
Neinvazní bezkontaktní metody identifikace a charakterizace živých mikroorganismů prostřednictvím optické spektroskopie a mikromanipulace

Kód projektu

GAP205/11/1687

Období řešení

1/2011 - 12/2014

Investor / Programový rámec / typ projektu

Grantová agentura ČR

Standardní projekty

Fakulta / Pracoviště MU

Lékařská fakulta

Spolupracující organizace

Akademie věd České republiky

Odpovědná osoba Mgr. Ota Samek, Dr.

Hlavním cílem navrhovaného výzkumného projektu je vývoj nových metod pro bezkontaktní neinvazní analýzu živých mikroorganismů (bakterií a eukaryotických buněk) v relevantních okolních podmínkách. Mikroorganismy suspendované v kapalném médiu či přisedlé k pevnému substrátu budou identifikovány a charakterizovány prostřednictvím jejich spekter Ramanova rozptylu, která poslouží jako otisk prstu typu buňky a jejího fyziologického stavu. Kombinace Ramanovy spektroskopie s optickými mikromanipulacemi a mikrofluidní platformou pak umožní provádění těchto analýz na úrovni jednotlivých buněk a studium odezvy mikroorganismů na definované vnější stimuly či stresové faktory. Experimentální data budou analyzována prostřednictvím vhodných matematických algoritmů a využita pro vytvoření spektrální knihovny mikroorganismů. Získané výsledky významně přispějí k rychlé identifikaci mikroorganismů ve studovaných vzorcích bez vnějších činidel a zhodnocení jejich infekčního potenciálu, čímž podpoří rozvoj efektivnějších strategií pro léčbu infekcí.

Publikace

Počet publikací: 8

2015

Identification of individual biofilm-forming bacterial cells using Raman tweezers

SAMEK Ota BERNATOVÁ Silvie JEŽEK Jan ŠILER Martin ŠERÝ Mojmir KRZYŽÁNEK Vladislav HRUBANOVÁ Kamila ZEMÁNEK Pavel HOLÁ Veronika RŮŽIČKA Filip

Článek v odborném periodiku

Journal of Biomedical Optics, rok: 2015, ročník: 20, vydání: 5, DOI

2014

Candida parapsilosis Biofilm Identification by Raman Spectroscopy

SAMEK Ota MLYNÁRIKOVÁ Katarína BERNATOVÁ Silvie JEŽEK Jan KRZYŽÁNEK Vladislav ŠILER Martin ZEMÁNEK Pavel RŮŽIČKA Filip HOLÁ Veronika MAHELOVÁ Martina

Článek v odborném periodiku

International Journal of Molecular Sciences, rok: 2014, ročník: 15, vydání: 12, DOI
Monitoring the influence of antibiotic exposure using Raman spectroscopy

SAMEK Ota ZEMÁNEK Pavel BERNATOVÁ Silvie JEZEK Jan SERY Mojmir JAKL Petr ŠILER Martin RŮŽIČKA Filip

Článek ve sborníku

Proceedings of SPIE : BIOMEDICAL VIBRATIONAL SPECTROSCOPY VI: ADVANCES IN RESEARCH AND INDUSTRY, rok: 2014
Raman tweezers on bacteria: Following the mechanisms of bacteriostatic versus bactericidal action

BERNATOVÁ Silvie SAMEK Ota PILAT Zdenek SERY Mojmir JEZEK Jan JAKL Petr ŠILER Martin KRZYŽÁNEK Vladislav ZEMÁNEK Pavel HOLÁ Veronika DVOŘÁČKOVÁ Milada RŮŽIČKA Filip

Článek ve sborníku

Proceedings of SPIE : BIOPHOTONICS: PHOTONIC SOLUTIONS FOR BETTER HEALTH CARE IV, rok: 2014
Výskyt Candida dubliniensis v klinickém materiálu a možnosti její identifikace

MAHELOVÁ Martina RŮŽIČKA Filip

Článek v odborném periodiku

Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie, rok: 2014, ročník: 63, vydání: 2

2013

Following the mechanisms of bacteriostatic versus bactericidal action using raman spectroscopy

BERNATOVÁ Silvie SAMEK Ota PILÁT Zdeněk ŠERÝ Mojmír JEŽEK Jan JÁKL Petr ŠILER Martin KRZYŽÁNEK Vladislav ZEMÁNEK Pavel HOLÁ Veronika DVOŘÁČKOVÁ Milada RŮŽIČKA Filip

Článek v odborném periodiku

Molecules, rok: 2013, ročník: 18, vydání: 11, DOI

2012

Nové možnosti detekce a identifikace klinicky významných mikromycet

RŮŽIČKA Filip HORKÁ Marie SAMEK Ota

Článek v odborném periodiku

Postgraduální medicína, rok: 2012, ročník: 14, vydání: příloha č. 5
Utilization of laser-ablation based methods for obtaining complete chemical information of Algae

POŘÍZKA Pavel PROCHAZKA David NOVOTNÝ Karel SAMEK Ota PILÁT Zdeněk PROCHÁZKOVÁ Klára KAISER Jozef

Článek v odborném periodiku

World Academy of Science, Engineering and Technology, rok: 2012, ročník: 72, vydání: 12